Theo quy định tại Nghị định số 123/2020/NĐ-CP ngày 19/10/2020:

- Tại khoản 2, điều 6, quy định về Bảo quản, lưu trữ hóa đơn, chứng từ:
2. Hóa đơn điện tử, chứng từ điện tử được bảo quản, lưu trữ bằng phương tiện điện tử. Cơ quan, tổ chức, cá nhân được quyền lựa chọn và áp dụng hình thức bảo quản, lưu trữ hóa đơn điện tử, chứng từ điện tử phù hợp với đặc thù hoạt động và khả năng ứng dụng công nghệ. Hóa đơn điện tử, chứng từ điện tử phải sẵn sàng in được ra giấy hoặc tra cứu được khi có yêu cầu.

- Tại khoản 4, điều 22, quy định về trách nhiệm của người bán hàng hóa, cung cấp dịch vụ sử dụng hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế4. Lưu trữ và bảo đảm tính toàn vẹn của toàn bộ hóa đơn điện tử; thực hiện các quy định pháp luật về bảo đảm an toàn, an ninh hệ thống dữ liệu điện tử.

=> Căn cứ các quy định nêu trên, trường hợp Đơn vị sử dụng hóa đơn điện tử (HĐĐT), thì trách nhiệm lưu trữ, bảo quản HĐĐT là trách nhiệm của Đơn vị, không phải Hệ thống HĐĐT của Cơ quan thuế. Đơn vị phải thực hiện tải hóa đơn, lưu trữ và bảo đảm tính toàn vẹn của toàn bộ hóa đơn điện tử theo định dạng XML tại hệ thống thông tin (máy tính) của Đơn vị.