Theo nội dung công văn của Công ty, cá nhân là Tổng giám đốc và nắm giữ 35% vốn điều lệ của Công ty Cổ phần ABC Việt Nam bảo lãnh tài chính cho Công ty vay vốn tại ngân hàng, giá trị bảo lãnh lớn hơn 25% vốn chủ sở hữu của Công ty. Đồng thời, công ty không có phát sinh khoản vay từ cá nhân bà Dịu thì không phát sinh giao dịch liên kết.

Trong trường hợp một doanh nghiệp bảo lãnh hoặc cho một doanh nghiệp khác vay vốn dưới bất kỳ hình thức nào (bao gồm cả các khoản vay từ bên thứ ba được đảm bảo từ nguồn tài chính của bên liên kết và các giao dịch tài chính có bản chất tương tự) thì việc xác định giao dịch liên kết thực hiện theo quy định tại điểm d khoản 2 Điều 5 Nghị định số 132/2020/NĐ-CP và được sửa đổi, bổ sung bởi Nghị định số 20/2025/NĐ-CP ngày 10/02/2025.

Trường hợp Công ty cổ phần năng lượng mới GT Việt Nam có trụ sở tại Hưng Yên, đăng ký thành lập Văn phòng đại diện tại Hà Nội, hạch toán phụ thuộc thì Công ty thực hiện kê khai thuế như sau:

+ Thuế giá trị gia tăng: Trường hợp Văn phòng đại diện (không phải cơ sở sản xuất) không trực tiếp bán hàng, không phát sinh doanh thu, không thuộc các trường hợp phân bổ thuế GTGT theo quy định tại khoản 1, khoản 3 Điều 13 Thông tư 80/2021/TT-BTC ngày 29/9/2021 thì Công ty thực hiện kê khai tập trung tại trụ sở chính.

+ Thuế thu nhập doanh nghiệp: Trường hợp Văn phòng đại diện (không phải cơ sở sản xuất) là đơn vị trực thuộc nhưng hạch toán phụ thuộc, không thuộc các trường hợp phân bổ thuế thu nhập doanh nghiệp theo quy định tại khoản 1, khoản 3 Điều 17 Thông tư 80/2021/TT-BTC ngày 29/9/2021 thì Văn phòng đại diện không phải nộp hồ sơ khai thuế thu nhập doanh nghiệp, Công ty có trách nhiệm kê khai tập trung tại trụ sở chính.

+ Thuế thu nhập cá nhân: Trường hợp Văn phòng đại diện không ký hợp đồng lao động, không trả lương cho người lao động, Công ty ký hợp đồng lao động và chi trả toàn bộ tiền lương, tiền công của nhân viên làm việc tại Văn phòng đại diện thì Văn phòng đại diện không phải kê khai nộp thuế TNCN, Công ty có trách nhiệm khấu trừ, kê khai nộp thuế TNCN theo quy định tại khoản 1, khoản 3 Điều 19 Thông tư 80/2021/TT-BTC ngày 29/9/2021.

Trường hợp Công ty có phát sinh hoạt động chuyển nhượng bất động sản không thuộc trường hợp quy định tại điểm b khoản 1 Điều 11 Nghị định 126/2020/NĐ-CP của Chính phủ thì Công ty kê khai thuế GTGT, TNDN của hoạt động chuyển nhượng bất động sản như sau:

-   Về thuế GTGT:

+   Tài sản gắn liền trên đất áp dụng thuế suất thuế GTGT 10% theo quy định tại khoản 3 Điều 9 Luật Thuế giá trị gia tăng 2024.

+   Chuyển quyền sử dụng đất gắn với cơ sở hạ tầng: Giá tính thuế GTGT là giá bán bất động sản chưa có thuế giá trị gia tăng, trừ (-) tiền sử dụng đất hoặc tiền thuê đất nộp ngân sách nhà nước (giá đất được trừ). Giá đất được trừ để tính thuế GTGT, Công ty phải có đầy đủ hồ sơ chứng từ chứng minh giá đất được trừ theo quy định tại Điều 8 Nghị định 181/2025/NĐ-CP ngày 01/07/2025 của Chính phủ. Sau khi trừ (-) giá đất được trừ thì áp dụng thuế suất thuế GTGT 10% theo quy định.

-   Về thuế TNDN:

+   Công ty xác định thu nhập chịu thuế TNDN đối với hoạt động chuyển nhượng bất động sản theo quy định tại Điều 16 Nghị định 320/2025/NĐ-CP ngày 15/12/2025 của Chính phủ. Thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp đối với hoạt động chuyển nhượng bất động sản là 20%.

+   Trường hợp doanh nghiệp vừa có hoạt động kinh doanh bất động sản vừa có hoạt động kinh doanh được hưởng ưu đãi thuế thì phải hạch toán riêng các khoản chi phí. Trường hợp không hạch toán riêng được chi phí của từng hoạt động thì chi phí chung được phân bổ theo tỷ lệ giữa doanh thu từ chuyển nhượng bất động sản so với tổng doanh thu của doanh nghiệp theo quy định tại khoản 2 Điều 17 Nghị định 320/2025/NĐ-CP ngày 15/12/2025 của Chính phủ.

Trường hợp Trung tâm trả tiền công, tiền thù lao, tiền chi khác cho cá nhân cư trú không ký hợp đồng lao động hoặc ký hợp đồng lao động dưới ba (03) tháng có tổng mức trả thu nhập từ hai triệu (2.000.000) đồng/lần trở lên thì Trung tâm phải khấu trừ thuế theo mức 10% trên thu nhập trước khi trả cho cá nhân theo quy định tại khoản 1 Điều 25 Thông tư 111/2013/TT-BTC ngày 15/8/2013 của Bộ Tài chính.

Thời điểm nộp hồ sơ khai thuế: Trung tâm nộp hồ sơ khai thuế theo quy định tại khoản 1 Điều 44 Luật Quản lý thuế 2019 của Quốc hội và kê khai thuế theo mẫu 05/KK-TNCN - Tờ khai thuế thu nhập cá nhân (áp dụng đối với tổ chức, cá nhân trả các khoản thu nhập từ tiền lương, tiền công).

Trường hợp hóa đơn GTGT đã lập và gửi cho người mua sau đó phát hiện sai về số tiền ghi trên hóa đơn, sai về thuế suất, tiền thuế thì người bán và người mua phải lập văn bản thỏa thuận ghi rõ nội dung sai và lập hóa đơn điện tử mới thay thế cho hóa đơn đã lập sai theo quy định tại khoản 13 Điều 1 Nghị định 70/2025/NĐ-CP ngày 20/3/2025 và khoản 6 Điều 12 Thông tư 32/2025/TTBTC ngày 31/5/2025 của Bộ Tài chính.

Căn cứ vào hóa đơn sau khi được xử lý, người bán, người mua kê khai điều chỉnh doanh thu, thuế đầu vào (nếu có) vào kỳ phát sinh hóa đơn bị điều chỉnh, bị thay thế quy định tại điểm 5 khoản 13 Điều 1 Nghị định 70/2025/NĐ-CP ngày 20/3/2025 của Chính phủ.

Trường hợp hóa đơn điều chỉnh, hóa đơn thay thế nêu trên dẫn đến hồ sơ khai thuế GTGT đã nộp cho cơ quan Thuế có sai, sót thì Công ty thực hiện kê khai bổ sung cho từng hồ sơ khai thuế có sai, sót theo quy định tại khoản 4 Điều 7 Nghị định 126/2020/NĐ-CP ngày 19/10/2020 của Chính phủ.

Các công văn trên tập trung vào các vấn đề quan trọng về xác định giao dịch liên kết, nguyên tắc kê khai thuế cho đơn vị phụ thuộc, thuế GTGT & TNDN khi chuyển nhượng bất động sản, khấu trừ thuế TNCN và xử lý hóa đơn sai sót. Doanh nghiệp cần rà soát quy trình kê khai thuế, hạch toán phân bổ chi phí và quy trình lập hóa đơn để đảm bảo tuân thủ đúng quy định hiện hành.